A vádirat szerint az volt a tervük, hogy támadásokat intéznek az örmény, görög és zsidó kisebbség tagjai ellen, de közben az iszlámbarát kormánypárt híveire terelik a gyanút, és ezzel aláássák a kormány hitelét. Perüket június 15-re tűzték ki. A csoport főként a haditengerészet nyugalmazott vagy aktív tisztjeiből áll, s van köztük három tengernagy is. Kafesnek (ketrec) elnevezett ügyüket egyelőre külön kezelik az Ergenekon-összeesküvéstől, de a bíróság később egyesítheti vele. Az állítólagos összeesküvéssel kapcsolatban már több száz civilt és katonatisztet vettek őrizetbe Törökországban. Sokak szerint a 2002 óta hatalmon lévő Igazság és Fejlődés Pártja a világi ellenzéket akarja megfélemlíteni a perekkel.

A párt tagadja, hogy iszlamista törekvései lennének, de a kormány előző nap bejelentette, hogy mentelmi jogot akar biztosítani az imámoknak. Ennek értelmében az iszlám hitszónokok ellen csak elöljárójuk beleegyezésével lehetne vádat emelni, korlátozva annak a lehetőségét, hogy az előimádkozókat politikai tartalmú kijelentések miatt büntetőjogi felelősségre vonják.