A Fehér Ház azután mondott le arról, hogy a nagy pert Manhattanben, a repülőgépes merénylők által romba döntött Világkereskedelmi Központ egykori ikertornyainak a tőszomszédságában tartsák meg, hogy Michael Bloomberg polgármester korábbi döntését megváltoztatva a héten közölte, nem támogatja a New York-i helyszínt.
Bloomberg és más New York-i politikusok azzal érvelnek: a manhattani per esetén a biztonsági és szervezési költségek csillagászati összegekre rúgnának.

A rendőrség becslése szerint a feltehetően több évig elhúzódó eljárás évente több mint 200 millió dollárjába kerülne a városnak, több mint kétezer ellenőrző pontot kellene felállítani az érintett kerületben. A városrész lakói sem fogadnák szívesen a folyamatos készültséget, ezenkívül az egész város biztonságát meg kellene erősíteni az esetleges újabb terrortámadásokkal szemben.

Eric Holder igazságügy-miniszter tavaly novemberben jelentette be, hogy polgári bíróság elé állítják a terroristát és négy társát, sorsukról nem katonai törvényszék fog dönteni. A Fehér Ház a héten megerősítette, Barack Obama elnök egyetért ezzel a döntéssel.

Ezzel azonban korántsem ért egyet mindenki, konzervatív szenátorok szerint  a terroristákat ellenséges harcosokként a szigorúbb és zártabb katonai bírósági eljárás során kellene elítélni. Érvelésük szerint egy amerikai szövetségi polgári eljárás módot adna a szélsőségeseknek, hogy azt kirakatperré változtatva a világ nyilvánossága előtt magasztalják tettüket és újabb harcosokat állítsanak a terrorizmus oldalára.
A jelenleg Kuba szigetén, a guantánamói katonai börtöntáborban őrzött terroristák bíróság elé állítása mérföldkő a Bush-féle terrorellenes háború lezárásában, Guantánamo felszámolásában.

A Fehér Ház közölte: az amerikai szövetségi börtönökben több száz elítélt terrorista raboskodik, tehát nincs akadálya annak, hogy a 9/11-es merényletek gyanúsítottjait elítéljék és amerikai földön rács mögé csukják. A per esetleges új helyszínére az igazságügyi tárca fog javaslatot tenni; Bloomberg szerint egy katonai támaszpont volna megfelelő, ahol olcsóbbak lennének a biztonsági intézkedések.

A 2973 halottat követelő 9/11-es merényletek értelmi szerzője, valamint a szervezésben közreműködő négy társa minden bizonnyal halálbüntetést fog kapni. Mohammed a vallatások során bevallotta: ő agyalta ki a repülőgép-eltérítéses támadásokat és tárta fel tervét Oszama bin Laden al-Kaida vezetőnek még 1996-ban. Pénzügyi támogatást kért a tervhez, felügyelte annak végrehajtását és részt vett a gépeltérítők kiképzésében Afganisztánban és Pakisztánban.