A cseh elnök döntését azzal indokolta, hogy Jirí Fajt művészettörténész évekkel ezelőtt a cseh Nemzeti Galéria igazgatójaként a szponzori adományok egy részét saját bérének megemelésére használta fel. Jan Eichler, a prágai Közgazdaságtudományi Egyetem nemzetközi kapcsolatok tanszékének vezetője a rendszerváltás előtt a csehszlovák néphadsereg politikai tisztje és propagandistája volt, Ivan Ostádal plazmafizikus neve pedig szerepel a kommunista titkosrendőrség (StB) ügynöklistáján. Jirí Ovcácek szóvivő szerint a cseh államfő nem aláíró-automata, nem hajlandó mindenre rábólintani, egyébként pedig alkotmányos joga mérlegelni, s megalapozott indok alapján pedig nemet mondani.

Tomás Zíma, a prágai Károly Egyetem rektora szerint viszont a három egyetemi oktató a vonatkozó törvényben előírt minden tudományos feltételt teljesített, a negatív átvilágítási bizonylatot vagy a korábbi politikai tevékenység vizsgálatát semmilyen jogszabály sem írja elő, ezért az elnöknek sincs joga káderezni. – Érdekes módon többször már olyan professzorokat is kinevezett, akik egykor a párfőiskolán szereztek diplomát. Ráadásul a kormánytagok kinevezésekor nem volt ennyire kényes, ott akadt miniszter, akinek a  gyanús múltja felett szemet hunyt – tette hozzá.

Kivétel nélkül bírálták az államfőt a cseh politikusok, mert ismét megsértette az akadémiai közösség autonómiáját. Petr Fiala, az oktatási tárca volt vezetője, jelenleg az ellenzéki Polgári Demokrata Párt (ODS) elnöke rámutatott: – Milos Zeman ismét igazolta, hogy a legnyugatabbra élő keleti despota.

A cseh államfő nem először döntött így. Másfél éve ugyancsak morális okokra hivatkozva nem írta alá Martin C. Putna ismert katolikus irodalomtörténész professzori kinevezését.

– Tiszteletben tartom minden személy szexuális orientáltságát, az sem zavar, ha Putna úr részt vesz a melegfelvonuláson, ám az ottani viselkedése megbotránkoztatott – érvelt akkor Milos Zeman. Az egyetemi oktató ugyanis a Prága Pride rendezvényen a „Katolikus buzik üdvözlik Bátorát!" feliratú transzparenssel menetelt. Így tiltakozott Ladislav Bátora volt oktatásügyi államtitkár magatartása ellen, aki a felvonulás betiltását követelte, a homoszexuálisokat pedig genetikailag hibás személyeknek nevezte. Végül Milos Zeman a heves tiltakozások után aláírta a kinevezést, de a dekrétumot nem ő, hanem az oktatásügyi miniszter adta át Putnának.