A hetilap május 9-én állította, hogy a déli parancsnokság vizsgálata szerint a kubai támaszponton meggyalázták, például vécén lehúzták a Koránt. Az emiatt Afganisztánban kitört zavargások már 16 emberéletet követeltek.

A Fehér Ház azt követeli, hogy a magazin a hír lényegét is cáfolja, erre azonban a szerkesztőség egyelőre nem hajlandó. Egy pakisztáni iszlám politikus, Kazi Husszain Ahmed a Reutersnek nyilatkozva azt mondta, a Newsweek visszavonulása nem fogja lecsillapítani az indulatokat, és a lap most nyomás alatt cselekszik. Több elengedett személy, például a brit állampolgárságú Aszif Ikbal már korábban azt mondta, hogy Guantánamo amerikai őrei a földön rugdosták, és a vécébe dobták a Koránt. A Newsweek egy magas beosztású, korábban megbízhatónak tekintett kormányzati forrástól értesült arról, hogy a déli parancsnokság jelentéstervezete kitér a vécés esetre. A Pentagon csak a cikk megjelenése után tíz nappal, az afganisztáni helyzet súlyosra fordulása után kezdte cáfolni az állítást.