Az FSCI és a PJLS szervezet szerint a minaretek építésének megtiltása veszélyezteti a vallásszabadságot, és árt a svájci  muzulmánok integrációjának. Ez diszkrimináció lenne, amely ellen e  szervezetek aktívan fellépnek a vallásszabadság és a vallási béke  érdekében - hangoztatták. Hozzáteszik ugyanakkor, hogy a két szervezet „világosan látja a vallási szélsőség veszélyét, és komolyan veszi a lakosság aggodalmait a szélsőséges eszmék svájci  terjedése miatt”.

A minaretek betiltásáról a népszavazást a jobboldali konzervatív Svájci Néppárt (SVP) és a vallási ihletésű Szövetségi Demokratikus Unió (EDU) politikusai kezdeményezték, akik ezzel „a svájci  társadalom növekvő iszlamizálódását” szeretnék megakadályozni. Szerintük a minaretek nem vallási jellegűek, hanem hatalmi követeléseket jelképeznek.